O sistema digestório é responsável pela digestão, processo através do qual o alimento é quebrado em moléculas menores que são absorvidas e distribuídas a todas as células do corpo. Na boca, ocorre a digestão mecânica do alimento e também tem início a digestão química. A secreção liberada na boca é a saliva, produzida pelas glândulas salivares. Ela contém a enzima amilase salivar, responsável pela quebra do amido em açúcares menores.

No estômago é liberado o suco gástrico (produzido pelas próprias células da parede desse órgão), uma solução aquosa contendo ácido clorídrico e as enzimas pepsina e renina. A pepsina digere proteínas, reduzindo-as a pequenas cadeias de aminoácidos chamadas oligopeptídios. A renina existe em pequenas quantidades em indivíduos adultos e tem a função de coagular as proteínas do leite para que permaneçam mais tempo no estômago, facilitando a sua digestão. O ácido clorídrico torna o pH do estômago bastante ácido, destruindo micro-organismos e amolecendo os alimentos para facilitar a ação da pepsina.

No intestino, já na sua primeira porção chamada duodeno, ocorre a liberação do suco pancreático e da bile. O suco pancreático é produzido pelo pâncreas e contém as enzimas tripsina (digere porção protéica dos alimentos, reduzindo os oligopeptídeos a aminoácidos), amilase pancreática (que termina a digestão do amido, reduzindo os açúcares a glicose e outros açúcares simples) e lípases (digerem as gosrduras).

A bile é uma substância produzida pelo fígado e que funciona como um detergente, emulsionando as gorduras, para facilitar a digestão dos lipídios (que é feita pelas enzimas lipases produzidas no pâncreas). Em outras palavras, a bile reduz o tamanho das gotas de gordura (insolúvel em água), para facilitar o acesso das enzimas pancreáticas, permitindo sua atuação.

No trajeto ao longo do intestino delgado, as moléculas simples resultantes da digestão vão sendo absorvidas, isto é, elas vão atravessando a parede do intestino (que tem sua superfície muito aumentada graças à presença de dobras denominadas vilosidades) e chegam à corrente sanguínea para serem distribuídas a todas as células do corpo. Na passagem pelo intestino grosso ocorre reabsorção de água e finalmente a eliminação do material não digerido através do ânus.